图示为D/RNA Circular Ligase催化长度为89个碱基的单链DNA在分子内5'和3'端连接成环后产物的10% PAGE变性胶图。
货号与规格:B4001-10ku
D/RNA Circular Ligase是T4 RNA Ligase 1的改进版,具备很好的热稳定性,可高效地催化单链的DNA或RNA分子内环化(intramolecular ligation)。
具体特征:
1)待环化的单链DNA/RNA模板的5'端需含有 -PO43-,3'端需为 -OH;
2)反应缓冲液中需添加ATP和Mn2+;
3)可环化长度超过30个碱基的单链DNA/RNA序列,对于较长(几百碱基)的序列,可咨询技术人员提升环化效率;
4)最佳反应温度在58-62摄氏度;
5)D/RNA Circular Ligase中无可检测到的kinase、DNase、RNase等酶活性;
6)具有等同于CircLigase(EpiCentre)的活性。
保存缓冲液:50% glycerol,50 mM Tris pH 7.5, 100 mM NaCl,0.1 mM EDTA,1 mM DTT,0.1% Triton X-100。
10X反应缓冲液:0.5 M MOPS pH 7.5,0.1 M KCl,50 mM MgCl2,10 mM DTT。在最终的1X反应体系中,需补充ATP至终浓度为0.05 mM,补充MnCl2至终浓度为2.5 mM。
Unit定义:1个unit的D/RNA Circular Ligase可催化1 pmol的长度为89个碱基的DNA模板序列在60度下1小时内成环,产率为40-50%。
产品规格:10000 units溶解在100 uL缓冲液中,浓度为100 units/uL。
说明及注意事项:
1)通常若反应体系过小,不建议使用大量的DNA或RNA模板。对于20 uL的反应体系,建议使用10 pmol以下的DNA/RNA;
2)若反应模板量较大,可增大反应体积。原则上来讲,反应体积越大,DNA/RNA浓度越低,越有利于intramolecular ligation;
3)若某些特定序列成环效率较低,可适当增加D/RNA Circular Ligase的用量,并延长反应时间至3-4小时。不建议过夜反应,在MnCl2存在的情况下,长时间反应可能造成DNA/RNA损伤或降解。